另外一种类型是“中枢性睡眠呼吸暂停”，相对比较少见，其原因主要是大脑不能对膈肌发出呼吸信号或者膈肌不能接受来自大脑的呼吸信号，多见于脑卒中、脑肿瘤、脊椎损伤或者神经肌肉功能障碍，比如ALS（肌萎缩性侧索硬化症）。而有些患者可能具有信号传递和接受双重障碍。
预防
减少风险因素可以帮助预防睡眠呼吸暂停的发生，甚至治疗轻度患者。如果体重减少10%，睡眠呼吸暂停的严重程度将降低50%。
睡觉之前避免饮酒，禁止服用镇静剂，如安眠药、肌肉松弛剂和抗组胺药等，这些对预防呼吸睡眠暂停具有关键作用。一些具有镇静作用的非处方药和草药，可能会加重呼吸睡眠暂停。
睡觉时采取侧卧位有利于气道的通畅，避免仰卧。为阻止身体翻滚，可把网球一半缝在T恤的背面或者接近颈部的睡衣领口处，另一半在中背部，或者把网球放入一个袋子中，然后再固定在睡衣的背部。
高危人群
危险因素包括：
超重或者肥胖
鼻、喉和上呼吸道生理异常
男性
高血压
颈围过大（男性超过43厘米；女性超过41厘米）
扁桃体或者腺体肿大
家族史
饮酒，服用安定或其他镇静剂
诊断
常见的症状包括睡醒后头痛、夜尿频繁、注意力不集中、记忆力减退、判断力下降、易激怒、心理或行为异常、焦虑和抑郁。小儿患者多表现为活动增多，可能误诊为“儿童多动症”。