马端临的历史进化思想，从上举各例中已大致可以看出一些。此外，他针对一些主张恢复“封建”和井田的议论，尖锐地批评说：对于秦制，“所袭既久，反古实难，欲复封建，是自割裂其土宇以启纷争；欲复井田，是强夺民之田亩以召怨讟。书生之论，所以不可行也”。他在讲到货币的质地和形式的变化时说：“夫珠玉、黄金，可贵之物也；铜虽无足贵，而适用之物也……至于以楮为币，则始以无用为用矣……然铜重而楮轻，鼓铸繁难而印造简易。今舍其重且难者，而用其轻且易者，而又下免犯铜之禁，上无搜铜之苛，亦一便也。”他认为这种变化的原因，是“古者俗朴而用简，故钱有余；后世俗侈而用糜，故钱不足。于是钱之直日轻，钱之数日多”。在这种发展趋势下，乃有飞券、钞引、交子、会子的出现，乃有以楮为币。这些认识，都是从承认历史的变化中看出了历史的进化。
《文献通考·自序》及诸多按语中所反映出来的马端临的历史思想是很丰富的，上面提到的是比较重要的几个方面。这足以说明，《文献通考》并非只是文献的简单排比，它是一部有明确的历史思想作指导而编纂起来的巨制。马端临在观察、阐述历史的方法论方面，给后人留下了不少值得总结的遗产。